Snelle DNA-Bibliotheek Prep Uitrusting V2 k001s-a, k001s-B
Productdetails:
Plaats van herkomst: | China |
Merknaam: | GDSBio |
Certificering: | ISO9001, ISO13485 |
Modelnummer: | K001S-A, K001S-B |
Betalen & Verzenden Algemene voorwaarden:
Min. bestelaantal: | 1 uitrusting |
---|---|
Verpakking Details: | het kleine pakket of de massa verdeelt of OEM |
Levertijd: | 8 het werkdagen |
Betalingscondities: | L/C, D/A, D/P, T/T, Western Union, MoneyGram |
Levering vermogen: | 1000 Uitrustingen per Dag |
Gedetailleerde informatie |
|||
Voorraad: | ja | Kat. Nr.: | K001S-A, K001S-B |
---|---|---|---|
Specificatie: | K001S-A/24 rxns; K001S-B/96 rxns; steekproefzak 6 rxns | Verschijning: | Volledig, geen schade |
Bibliotheektype: | DNA | Het rangschikken van Platform: | Illumina |
Logo Printing: | Met Logo Printing | Vervoerpakket: | Verpakking |
Productiecapaciteit: | 1000 Uitrustingen per Dag | Opslagvoorwaarden: | -20°C, met een geldigheidsperiode van 12 maanden. |
Hoog licht: | De Bemonsteringsbuis van het GDSBio Beschikbare Virus,Klasse I de Beschikbare Buis van de Virusbemonstering,100% de nylon buis van de virusbemonstering |
Productomschrijving
Snelle DNA-Bibliotheek Prep Uitrusting V2
[Productnaam]
Snelle DNA-Bibliotheek Prep Uitrusting V2
[Kat. Nr. /Spec.]
K001S-A/24 rxns; K001S-B/96 rxns; steekproefzak 6 rxns
[Productomschrijving]
Beogend Illumina-hoog-productie die platform rangschikken, verstrekt deze uitrusting een geschikte en universele DNA-regeling van de bibliotheekbouw in één buis. Het combineert eind reparatie en a-De steel verwijdert van in één die stap, zeer verkortend de tijd van bibliotheekbouw en verminderend de fout door vervelende stappen wordt veroorzaakt. De eindvoorbereiding, de adapterafbinding, de versterking en de reiniging van versplinterde double-stranded DNA kunnen binnen ongeveer 2 uren worden uitgevoerd. De volledige bibliotheekgetalsmatige weergave kan door methode van de dsDNA de fluorescente kleurstof (b.v., Thermoqubit Flex Fluorometer) of absolute getalsmatige weergavepcr worden uitgevoerd na het verdunnen van de bibliotheek aan een aangewezen concentratie.
[Steekproeftype]
Toepassing | Steekproeftype | Geadviseerd Bedrag |
Het gehele genoom rangschikken | Hoog - kwaliteits complexe genomen | 50ng-1μg |
Het doel vangt het rangschikken van gehele exome | Hoog - kwaliteits complexe genomen | 10ng-1μg |
Het doel vangt het rangschikken van geheel genoom | FFPE DNA | ≥50ng |
Het doel vangt het rangschikken van geheel genoom | cfDNA/ctDNA | ≥100pg |
Het gehele genoom rangschikken | Microbieel genoom | 1ng-1μg |
Het gehele genoom (PCR-Vrij) rangschikken | Hoog - kwaliteitsdna |
≥50ng (geen grootteselectie) ≥200ng (grootteselectie) |
Spaander-Seq | Spaanderdna | ≥100pg |
Het gerichte rangschikken | Amplicon | ≥100pg |
[Opslagvoorwaarde & Houdbaarheid]
Alle reagentia zouden bij -20°C.-Afbindingsbuffer moeten worden opgeslagen is normaal voor kristallen om bij lage temperaturen te storten, zou het aan kamertemperatuur v3o3or gebruik moeten worden in evenwicht gebracht. Het product is geldig 12 maanden.
[Componenten]
Component | 24 rxns | 96 rxns |
Beëindigenreparatie & a-De steel verwijderende van Enzymmengeling | 120 μl | 2×240 μl |
Beëindigenreparatie & a-De steel verwijderende van Buffer | 240 μl | 2×480 μl |
Snelle DNA-Ligase | 120 μl | 2×240 μl |
Snelle Afbindingsbuffer | 600 μl | 4×600 μl |
2× HIFIbibliotheekpcr Hoofdmengeling | 600 μl | 4×600 μl |
Inleiding Mix* | 120 μl | 480 μl |
* Als er meer dan één steekproef is, wordt de mengeling van de de adapterinleiding van #K002 en #K003-geadviseerd. Deze uitrusting voorziet een reeks inleidingen van index.
Nota: geadviseerde selectieparels: De Selectie Magbeads van DNA van #NC1011 GDSPure of de parels van AMPure XP.
[Nota's]
1. Wij bieden twee types van Universele geplaatste aan Adapterinleidingen (GDS-afzonderlijk gekochte Adapter, #K002 en #K003,), maar de klanten kunnen ook van andere fabrikanten kiezen of hun eigen Adapter voor Illumina samenstellen rangschikkend platform. Teveel Adapter zal leiden tot de vorming van Adapterdimeer, en de ontoereikende Adapter zal leiden tot lage bibliotheekoutput. Daarom bepaalt de aangewezen Adapterconcentratie de concentratie en de kwaliteit van bibliotheek. De geadviseerde adapterconcentraties voor verschillende hoeveelheden DNA-input worden getoond in de volgende lijst:
Lijst 1 Geadviseerde Gebruiksconcentraties van Adapter
DNA-Input | Geadviseerd Conc. voor Adapter | Adapter: Tussenvoegselmol Ratio* | GDS-de Graden van de Adapterverdunning |
1μg | 10μM | 10:1 | Geen verdunning |
500ng | 10μM | 20:1 | Geen verdunning |
250ng | 10μM | 40:1 | Geen verdunning |
100ng | 7.5μM | 100:1 | 3:4 |
50ng | 5μM | 200:1 | 1:2 |
25ng | 2.5μM | 200:1 | 1:4 |
1ng | 1μM | 200:1 | 1:10 |
* Adapter: De verhouding van de tussenvoegselmol verwijst naar de verhouding van het Adapter maalaantal uit andere bronnen aan het maalaantal van Inputdna, dat ruwweg kan worden berekend door naar de volgende formule te verwijzen:
De massa van het aantal (pmol) ≈Input DNA van inputdna (ng)/[0.66×Input-de gemiddelde lengte van DNA (bp)]
*The de kwaliteit en de concentratie van de Adapter beïnvloeden zeer de output van de bibliotheek, vooral voor lage inputbibliotheken. De Adapter uit een bron zou van uitstekende kwaliteit moeten aan een aangewezen concentratie met 0.1×TE vóór afbinding worden geselecteerd en worden verdund. Voor direct gebruik, zorg ervoor dat elke steekproeftoevoeging vaste 5 μl is, vermijden de fouten van de steekproeftoevoeging, en proberen om herhaalde freeze-thaw te vermijden.
2. Het enzym in 2× HIFIbibliotheekpcr Hoofdmengeling wordt gebruikt is een B-polymerase van familiedna, die 5 ‚- 3‘ polymerase en 3 ‚- 5‘ exonucleaseactiviteiten heeft, maar 5 ‚- 3‘ exonucleaseactiviteiten die niet heeft. Het heeft hifi en homogeniteit, en sterke duurzame synthesecapaciteit. De strikte controle van het aantal versterkingscycli is bijzonder belangrijk voor bibliotheekoutput. De volgende lijst toont het geadviseerd aantal versterkingscycli die aan verschillende ingevoerde hoeveelheden DNA beantwoorden:
Lijst 2 Geadviseerd Aantal Versterkingscycli die aan Verschillende Steekproefinput beantwoorden
Inputdna | Geadviseerd Aantal Versterkingscycli | |
100ng bibliotheek | 1μg bibliotheek | |
1μg | 0 | 2-5 |
500ng | 0 | 2-5 |
250ng | 1-3 | 5-7 |
100ng | 2-4 | 6-8 |
50ng | 4-6 | 8-10 |
25ng | 5-7 | 9-12 |
10ng | 7-9 | 11-13 |
5ng | 9-11 | 13-14 |
2.5ng | 10-12 | 14-16 |
1ng | 11-13 | 15-17 |
Nota: 1. De bovengenoemde lijst geeft de testresultaten weer gebruikend 150bp standaarddna, die voor slechts verwijzing is.
2. Als de onvolledige schakelaars worden gebruikt, zou een minimumaantal cycli (1-3) moeten worden vergroot om een volledige bibliotheek te verkrijgen.
3. Als de kwaliteit van inputdna slecht is, of de grootteselectie tijdens de bibliotheekbouw wordt uitgevoerd, zou het aantal versterkingscycli geschikt moeten worden verhoogd.
[Het Standaardproces van de Bibliotheekbouw]
Beëindigenreparatie
Nota: Als versplinterde DNA 45 μl vóór deze stap overschrijdt, of de buffer met de buffer van de eindreparatie onverenigbaar is, zou een magnetische parelreiniging eerst moeten worden uitgevoerd.
1. Bereid de volgende reactie in een PCR 200 μl buis voor:
Reagentia | Volume |
Versplinterde DNA | Veranderlijk |
Beëindigenreparatie & a-De steel verwijderende van Enzymmengeling | 5 μl |
Beëindigenreparatie & a-De steel verwijderende van Buffer | 10 μl |
ddH2 O | Aan 65 μl |
2. De draaikolk zacht en rotatie neer kort zich goed de te mengen, centrifugeren en verzamelen kort al vloeistof aan de bodem van de buis.
3. Voer de volgende reactie in een thermische cycler uit:
Temperatuur | Tijd |
20°C | 15min |
65°C | 15min |
4°C | ∞ |
Adapterafbinding
1. Ga zo spoedig mogelijk te werk met de afbindingsreactie na eindvoorbereiding.
2. Verdun de adapter volgens Lijst 1.
3. Bereid het volgende reactiesysteem voor:
Reagentia | Volume |
Beëindigenreparatie en a-De steel verwijderende van producten | 65 μl |
Snelle Afbindingsbuffer | 25 μl |
Snelle DNA-Ligase | 5 μl |
Adapter X | 5 μl |
Totaal | 100 μl |
4. De draaikolk zacht en rotatie neer kort zich goed de te mengen, centrifugeren en verzamelen kort al vloeistof aan de bodem van de buis.
5. Voer de volgende reactie in een thermische cycler uit:
Temperatuur | Tijd |
20°C | 15min |
4°C | ∞ |
Geadviseerde Oplossing voor PCR Schoonmaakbeurt/Grootteselectie (het specifieke magnetische parelvolume zou volgens de daadwerkelijke steekproefgrootte moeten worden aangepast)
1. Bereid 100 μl afbindingsproducten in een aangewezen centrifugebuis voor.
2. Voeg 100 μl van opnieuw uitgestelde DNA-selectie magnetische parels aan de steekproef toe. Blaas zacht met een pipet voor 10 keer (of draaikolk voor jaren '30). Broed steekproeven voor 5 min uit bij kamertemperatuur.
3. Plaats de buis op een aangewezen magnetisch rek om de parels van de bovendrijvende substantie te scheiden. Wanneer de oplossing duidelijk is, verwijder en verwerp zorgvuldig de bovendrijvende substantie met een pipet (verwerp geen parels).
4. Voeg 200 μl van vers voorbereidingen getroffen van 80% ethylalcohol aan de buis toe terwijl in het magnetische rek. Broed bij kamertemperatuur uit voor jaren '30, en zorgvuldig verwijder en verwerp dan de bovendrijvende substantie (stoor geen parels).
5. Herhaal eens Stap 4 voor een totaal van twee wassen.
Nota: Ben zeker om al zichtbare vloeistof na de tweede was te verwijderen.
6. Droog de parels aan de lucht tot de oppervlakte van de magnetische parels geen duidelijke glans heeft terwijl de buis op het magnetische rek met het open deksel is.
Nota: niet overdry de parels, kan dit in lagere terugwinning van DNA resulteren. Wanneer de parels beginnen te barsten, zijn zij te droog.
7. Verwijder de buis uit het magnetische rek. Voeg elution 22 μl buffer (10mM tris-HCl, pH8.0-8.5) aan de buis toe. Mengeling goed door boven en beneden minstens 10 keer of op een draaikolkmixer voor jaren '30 pipetting. Broed voor 3-5 min uit bij kamertemperatuur.
8. Plaats de buis op het magnetische rek. Na 5 min (of wanneer de oplossing) duidelijk is, breng bovendrijvende substantie 20 μl naar een nieuwe buis over. De selectie wordt voltooid, en geselecteerde DNA kan voor verdere experimenten worden gebruikt of bij -20°C lange tijd worden opgeslagen.
Bibliotheekversterking
1. Bereid de volgende reactie in een PCR 200 μl buis voor:
Reagentia | Volume |
Afbindingsproducten na schoonmaakbeurt of grootteselectie | 20 μl |
2× HIFIbibliotheekpcr Hoofdmengeling | 25 μl |
Inleidingsmengeling | 5 μl |
Totaal | 50 μl |
2. De draaikolk zacht en rotatie neer kort zich goed de te mengen, centrifugeren en verzamelen kort al vloeistof aan de bodem van de buis.
3. Voer de volgende reactie in een thermische cycler uit:
Temperatuur | Tijd | Cyclusaantal |
95°C | 3min | 1 |
98°C | 20sec |
Selecteer aangewezen aantal cycli volgens Lijst 2 |
60°C | 15sec | |
72°C | 30sec | |
72°C | 5min | 1 |
4°C | ∞ | - |
Geadviseerde Oplossing voor PCR Schoonmaakbeurt/Grootteselectie (het specifieke magnetische parelvolume zou volgens de daadwerkelijke steekproefgrootte moeten worden aangepast)
1. Bereid 50 μl afbindingsproducten in een aangewezen centrifugebuis voor.
2. Voeg 45 μl van opnieuw uitgestelde DNA-selectie magnetische parels aan de steekproef toe. Blaas zacht met een pipet voor 10 keer (of draaikolk voor jaren '30). Broed steekproeven voor 5 min uit bij kamertemperatuur.
3. Plaats de buis op een aangewezen magnetisch rek om de parels van de bovendrijvende substantie te scheiden. Wanneer de oplossing duidelijk is, verwijder en verwerp zorgvuldig de bovendrijvende substantie met een pipet (verwerp geen parels).
4. Voeg 200 μl van vers voorbereidingen getroffen van 80% ethylalcohol aan de buis toe terwijl in het magnetische rek. Broed bij kamertemperatuur uit voor jaren '30, en zorgvuldig verwijder en verwerp dan de bovendrijvende substantie (stoor geen parels).
5. Herhaal eens Stap 4 voor een totaal van twee wassen.
Nota: Ben zeker om al zichtbare vloeistof na de tweede was te verwijderen.
6. Droog de parels aan de lucht tot de oppervlakte van de magnetische parels geen duidelijke glans heeft terwijl de buis op het magnetische rek met het open deksel is.
Nota: niet overdry de parels, kan dit in lagere terugwinning van DNA resulteren. Wanneer de parels beginnen te barsten, zijn zij te droog.
7. Verwijder de buis uit het magnetische rek. Voeg elution 22 μl buffer (10mM tris-HCl, pH8.0-8.5) aan de buis toe. Mengeling goed door boven en beneden minstens 10 keer of op een draaikolkmixer voor jaren '30 pipetting. Broed voor 3-5 min uit bij kamertemperatuur.
8. Plaats de buis op het magnetische rek. Na 5 min (of wanneer de oplossing) duidelijk is, breng bovendrijvende substantie 20 μl naar een nieuwe buis over. De selectie wordt voltooid, en geselecteerde DNA kan bij 2-8°C 1-2 weken worden opgeslagen of bij -20°C lange tijd worden opgeslagen.
[Bijlage] Geadviseerde Regeling voor Tweezijdige Selectie
Als dubbel-rond de selectie wordt vereist, verstrekken wij de volgende regeling om het aangewezen magnetische parelvolume volgens de verwachte bibliotheekgrootte te selecteren. De grootteselectie kan vóór eindreparatie of na versterking worden uitgevoerd. Twee of meer dubbel-om selectie zullen zeer de bibliotheekopbrengst verminderen.
Vul het bibliotheekvolume in de lijst hieronder aan 100 μl. Selecteer het volume van magnetische parels in twee rondes volgens de verwachte bibliotheekgrootte. En voer de selectieverrichting volgens de volgende instructies uit.
Lijst 3 Geadviseerde Hoeveelheid Magnetische Parels voor dubbel-Ronde Selectie
Verwachte Bibliotheekgrootte | 150bp | 200bp | 250bp | 300bp | 400bp | 500bp | 600bp | 700bp | |
Volume van Parels (μl) | Om 1 | 100 | 90 | 80 | 70 | 60 | 55 | 50 | 45 |
Om 2 | 30 | 20 | 20 | 20 | 20 | 15 | 15 | 15 |
1. Vul het bibliotheekvolume aan 100 μl in een 200μl-PCR buis en geëtiketteerd als A. Add een bepaald volume van Magnetische parels volgens Lijst 3 (om 1) aan de slag van buisa. Gently met een pipet voor jaren '30. Broed steekproeven voor 5 min uit bij kamertemperatuur.
2. Plaats de buis A op een aangewezen magnetisch rek om de parels van de bovendrijvende substantie te scheiden. Wanneer de oplossing duidelijk is, verwijder zorgvuldig de bovendrijvende substantie aan een nieuwe buis en etiketteer het als parels van B. Discard.
3. Toevoeg een bepaald volume van Magnetische parels volgens Lijst 3 (om 2) aan de buis B. Blaas zacht met een pipet voor jaren '30. Broed steekproeven voor 5 min uit bij kamertemperatuur. Plaats de buis B op magnetisch rek. Wanneer de oplossing duidelijk is, verwijder en verwerp zorgvuldig de bovendrijvende substantie.
4. Voeg 200 μl van vers voorbereidingen getroffen van 80% ethylalcohol aan de buis B toe terwijl in het magnetische rek. Broed bij kamertemperatuur uit voor jaren '30, en zorgvuldig verwijder en verwerp dan de bovendrijvende substantie (stoor geen parels).
5. Herhaal eens Stap 6 voor een totaal van twee wassen.
Nota: Ben zeker om al zichtbare vloeistof na de tweede was te verwijderen.
6. Droog de parels aan de lucht tot de oppervlakte van de magnetische parels geen duidelijke glans heeft terwijl de buis B op het magnetische rek met het open deksel is.
Nota: niet overdry de parels, kan dit in lagere terugwinning van DNA resulteren. Wanneer de parels beginnen te barsten, zijn zij te droog.
7. Verwijder de buis B uit het magnetische rek. Voeg elution 22 μl buffer aan de buis toe. Mengeling goed door boven en beneden minstens 10 keer of op een draaikolkmixer voor jaren '30 pipetting. Broed voor 3-5 min uit bij kamertemperatuur.
Nota: Indien gericht vang niet zal gepresteerd worden, toevoegen elution buffer (10mM tris-HCl, ph 8.0-8.5) voor elution. Anders, zou het gesteriliseerde ultrapurewater voor elution moeten worden gebruikt.
- Plaatsbuis B op het magnetische rek. Overdracht 20 bovendrijvende substantie μl aan een nieuwe buis.
Voor Onderzoek slechts Gebruik